Для топографии, созданной на основе SRTM, это обычное дело.
Считай, что на момент замера водоем пересох....

Уровень воды в наших реках значительно выше уровня Мирового Океана, взятого за исходную 0 отметку, поэтому такое отображение вполне объяснимо.